Odeljenje za genetiku populacija i ekogenotoksikologiju

Rukovodilac:
akademik Marko Anđelković
redovni profesor Biološkog fakulteta, Univerziteta u Beogradu
naučni savetnik IBISS
markoa@ibiss.bg.ac.rs
Spisak saradnika na odeljenju:
dr Marina Stamenković-Radak
vanredni profesor Biološkog fakulteta, Univerziteta u Beogradu
naučni savetnik IBISS
marina@bio.bg.ac.rs
dr Tatjana Savić
naučni saradnik IBISS
tanjat@ibiss.bg.ac.rs
dr Zorana Kurbalija
naučni saradnik IBISS
kurbalija@ibiss.bg.ac.rs
Bojan Kenig
istraživač saradnik IBISS
bojan.kenig@gmail.com
Aleksandra Patenković
istraživač saradnik IBISS
aleksandra@ibiss.bg.ac.rs
Ivana Bukvić
samostalni tehnički saradnik IBISS
ivanabukvic@ibiss.bg.ac.rs
Projekti na odeljenju:
Adaptivni značaj genetičkog polimorfizma populacija Drosophila #143014
Delatnost odeljenja:
Odeljenje za genetiku populacija i ekogenotoksikologiju je jedna od organizacionih jedinica Instituta za biološka istraživanja „Siniša Stanković“ Univerziteta u Beogradu koja se razvila iz Odeljenja za genetiku a koje je bilo jedno od dva odeljenja Biološkog instituta u trenutku nujegovog formiranja 1947. godine.
Odeljenje za genetiku populacija i ekogenotoksikologiju bavi se istraživanjima genetičkih fenomena vezanih za dinamiku genofona populacija i adaptivne procese. Istraživanja se obavljaju korišćenjem različitih vrsta roda Drosophila. Jedinke ovog roda, zbog svoje biologije, predstavljaju izuzetno dobar model-sistem za populaciono-genetička istraživanja, koji je opšte prihvaćen i intenzivno korišćen kod nas i u svetu.
U ovom trenutku istraživanja obuhvataju tri tematske celine:
- prostorna i vremenska dinamika inverzionog polimorfizma Drosophila subobscura i njegov adaptivni značaj;
- populaciono-genetičke i ekološko-genetičke studije polimorfizma Amy-lokusa Drosophila subobscura;
- uticaj genomskog i sredinskog stresa na genetičku i fenotipsku varijabilnost i razvojnu homeostazu u prirodnim i laboratorijskim populacijama Drosophila
- ekogenotoksikološka i genotoksikološka istraživanja na vrstama roda Drosophila
Prostorna i vremenska dinamika inverzionog polimorfizma Drosophila subobscura i njegov adaptivni značaj
Postojanje politenih hromozoma kod vrsta roda Drosophila kao i drugih vrsta Diptera omogućavaju precizne citogenetičke analize strukturnih hromozomskih aberacija. Analiza inverzionog polimorfizma u okviru populacija vrsta roda Drosophila vrši se u cilju sagledavanja medjupopulacijske i unutarpopulacijske promenljivosti ovog vida genetičkog polimorfizma a posebno sa aspekta postojanja koadaptivnih genskih sistema u okviru inverzija i inverzionih kompleksa. Istraživanja inverzionog polimorfizma Drosophila subobscura se odvijaju i u pravcu potpunijeg sagledavanja adaptivne uloge ovog vida genetičkog polimorfizma, a posebno u svetlu različitih vidova antropogenog uticaja na ekosisteme.
Populaciono-genetičke i ekološko-genetičke studije polimorfizma Amy-lokusa Drosophila subobscura
Alozimski polimorfizam Amy-lokusa i varijabilnost specifične enzimske aktivnosti α-amilaze kod D.subobscura koristi se kao model sistem sa aspekta proučavanja adaptivnog značaja gensko-enzimskog polimorfizma. Proučavanja se odnose na obim i pravac pomenute genske, i za nju vezane biohemijsko-fenotipske varijabilnosti, u funkciji nekih komponenti adaptivne vrednosti kod određenih genotipova pri različitom obimu i dinamici promene koncentracije skroba u supstratu.
Razvojna stabilnost i fluktuirajuća asimetrija
Savremena shvatanja razvojnih procesa doprinose boljem razumevanju prirode interakcije genotipa i sredine u formiranju fenotipa. Jedan od aspekata tih istraživanja je praćenje razvojne stabilnosti organizama.
Fluktuirajuća asimetrija (FA) bilateralno simetričnih karaktera (kao što su veličina i oblik krila, broj čekinja u sternopleuralnom regionu, broj zubaca u polnim češljevima mužjaka i dr.) koristi se kao indikator za procenu narušavanja razvojne stabilnosti. na molekularnom, hromozomskom i epigenetskom nivou, što se ogleda kroz promenu FA indeksa.
Koristeći ovaj pristup proučavaju se efekti stresa pod uticajem sredinskih faktora (elektromagnetno polje veoma niske frekvencije, permanentno magnetno polje, različite koncentracije olova) i genomskog stresa (inbriding, autbriding i interspecijska hibridizacija).
Aplikativna istraživanja - ispitivanje genotoksičnih i antimutagenih efekata pojedinih supstanci u testovima na Drosophila
Sve učestalije prisustvo u životnoj i radnoj sredini agensa, koji kroz svoju biološku aktivnost mogu izazvati promene na genetičkom materijalu jedinki, a time i u genofondovima populacije organizama aktuelizuju ekogenotoksikološka i genotoksikološka istraživanja.
Cilj genotoksikoloških istraživanja je da utvrde potencijal sredinskih agenasa da izazovu oštećenja i/ili trajne promene na naslednom materijalu organizama, prvenstveno čoveka. U okviru našeg odeljenja genotoksikološka ispitivanja se vrše korišćenjem dva standardizovana testa. Jedan je test za polno vezane recesivne letalne mutacije kod Drosophila melanogaster (SLRL), drugi je test somatskih mutacija i rekombinacija kod Drosophila melanogaster (SMART). Pored utvrdjivanja genotoksičnog i eventualnog kancerogenog efekta pojedinih supstanci ovi testovi omogućavaju detektovanje antimutagene i antikancerogene aktivnosti nekih agenasa ili njihovih mešavina prirodnog porekla (biljni ekstrakti, npr).
Odabrane reference članova Odeljenja za genetiku populacija i ekogenotoksikologiju
Selected references of associates in Department of population genetics and genotoxicology
Kurbalija Z., B. Kenig., Ј. Plavša, M.Stamenkovic-Radak and M. Andjelkovic (2010): The effect of lead on developmental stability of Drosophila subobscura through selection in laboratory conditions.. Archives of Biological Sciences, 62(1). In press.
Kurbalija Z., M. Stamenkovic-Radak, C. Pertoldi, M. Andjelkovic (2009) Outbreeding causes developmental instability in Drosophila subobscura. Evolutionary Ecology, doi: 10.1007/s10682-009-9342-0.
Jelić, M., B.Kenig, Z.Kurbalija, M.Stamenković-Radak and M.Andjelković (2009): Intra-species differentation among Drosophila subobscura from different habitats in Serbia. Archives of Biological Sciences, 61(3): 513-521.
- Patenković, A., M.Stamenković-Radak, T.Banjac, M.Andjelković (2009): Antimutagenic efect of sage tea in the wing spot test of Drosophila melanogaster. Food and Chemical Toxicology, 47(1): 180-183.
- Savić, T., M.Milanović, M.Stamenković-Radak and M.Andjelković (2008): Adaptive significance of amylase polymorphism in Drosophila: Effect of substrates with different carbohydrate composition on some life-history traits of Drosophila subobscura. Russian Journal of Genetics, 44(3): 279-286.
- Stamenković-Radak, M, G.Rašić, T.Savić. P.Kalajdzić, Z.Kurbalija, B.Kenig, M.Andjelković (2008): Monitoring of the genetic structure of natural population size and inversion polymorphism in Drosophila subobscura. Genetica, 133( ): 57-63.
- Stamenković-Radak, M., P.Kalajdžić, T.Savić, M.Savić, Z.Kurbalija, G.Rašić and M.Andjelković (2008): The effect of lead on fitness components and developmental stability in Drosophilasubobscura. Acta Biologica Hungarica 59(1): 47-56.
- Stamenković-Radak, M., G.Rašić, M.Cucković, T.Savić and M.Andjelković (2008): Effect of microhabitat variability on body size in Drosophila subobscura. Folia biologica, 56(1-2): 51-56.
- Rašić, G., M.Stamenković-Radak, T.Savić and M.Andjelković (2008): Inbreeding reveals interpopulation differences in inversion polymorphism of Drosophila subobscura. Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research, 46(1): 31-37.
- Andjelković, M., M.Stamenković-Radak, Z.Kurbalija, B.Kenig, G.Rašić, V.Savković, P.Kalajdžić, T.Savić and M.Savić (2007): The study of chromosomal inversion polymorphism of Drosophila subobscura over years in two different habitats from mountain Goč. Genetika, 39(2): 155-167.
- Kalajdzić, P., M.Stamenković-Radak and M.Andjelković (2006): The effect of different concentrations of lead on inversion polymorphism in Drosophila subobscura. Hereditas, 143(1): 42-47.
- Stanojević, V., Prolić Z, T.Savić, D.Todorović, B.Janać (2005): Effects of extremely low frequency (50 Hz) magnetic field on development dynamics of the housefly (Musca domestica L.). Electromagn Biol Med 24(2):99-107.
- Stamenković-Radak, M., T.Savić, M.Vićentić, M.Andjelković (2005): Atigenotoxic effects of royal jelly in the sex linked recessive lethal test with Drosophila melanogaster. Acta Veterinaria, 55(4): 301-306.
- Savković, V., M.Stamenković-Radak and M.Andjelković (2004): Diurnal variability of gene arrangement frequencies in Drosophila subobscura populations from two habitats. Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research, 42(3): 208-214.
- Andjelković, M., V.Savković and P.Kalajdžić (2003): Inversion polymorphism in Drosophila subobscura from two different habitats from mountain of Goč. Hereditas, 138(3): 241-243.
- Stamenkovic-Radak, M., M.Milanovic, T.Savic and M.Andjelkovic (2003): Adaptive significance of amylase polymorphism in Drosophila XIII. Old World obscura species subgroup divergence according to biochemical properties of α-amylase. Genes and Genetic Systems, 78(1): 23-28.
- Andjelković, M., T.Savić, M.Milanović and M.Stamenković-Radak (2003): Adaptive significance of amylase polymorphism in Drosophila. XII. density- and frequency-dependent selection at Amy locus in Drosophila subobscura reared on media with different carbohydrate composition. Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research, 41(2): 137-143.
- Živanović, G., M.Andjelković and D.Marinković (2002): Chromosomal inversion polymorphism of Drosophila subobscura from south-eastern part of Europe. Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research, 40(3): 201-204.
- Kitanović, I., M.Stamenković-Radak, T.Savić, A.Popović, I.Tomišić, V.Savković and M.Andjelković (2001): A genotoxicity test of the Danube river waters after accidental pollution; SLRL test on D.melanogaster. Archives of Biological Sciences, 53(3-4).
- Stamenković-Radak, M., I.Kitanović, Z.Prolić, I.Tomišić, B.Stojković and M.Andjelković (2001): Effect of a permanent magnetic field on wing size parameters in Drosophila melanogaster. Bioelectromagnetics, 22(5): 365-369.
- Živanović, G., M.Andjelković and D.Marinković (2000): Genetic load and coadaptation of chromosomal inversions. II. O-chromosomes in Drosophila subobscura populations. Hereditas, 133(4): 105-113.
- Terzić, T., M.Milanović, M.Ivanović, M.Stamenković-Radak, M.Andjelković (1999): Adaptive significance of amylase polymorphism in Drosophila. Analysis of the association between tissue-specific expression and specific activity in AmyS or AmyF genotypes of Drosophila subobscura. Genetics Selection Evolution, 31(1): 91-99.
- Stamenković-Radak, M., T.Terzić and M.Andjelković (1998): Mating discrimination and wing size differences after selection for mating speed both sexes of D.melanogaster. Acta entomologica serbica, 3(1-2): 85-92.
- Andjelković, M., G.Živanović, and M.Milanović (1998): Genetic loads and coadaptivity of chromosomal inversions I. Inversions polymorphism and genetic load of chromosome O in Drosophila subobscura population from Petnica. Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research, 36(3): 123-128.
- Terzić, T., M.Andjelković, D.Marinković and M.Stamenković-Radak (1996): Frequency dependent selection: I. Rare male phenomenon in D.subobscura dependent on the proportion of Amy genotypes and substrate composition. Journal of Evolutionary Biology, 9(3): 337-355.
- Stojiljković, V., M.Milanović, M.Milošević, M.Andjelković and D.Marinković (1995): Adaptive significance of amylase polymorphism in Drosophila. X. Analysis of alpha-amylase activity of two amylase variants in individual Drosophila subobscura flies. Japanese Journal of Genetics, 70(4): 487-495.
- Živanović, G., M.Milanović and M.Andjelković (1995): Chromosomal inversion polymorphism of Drosophila subobscura populations from Jastrebac Mountain shows temporal and habitat-related changes. Journal of Zoological Systematic and Evolutionary Research, 33(2): 81-83.
- Stamenković-Bojić, G., M.Milanović and M.Andjelković (1994): Adaptive significance of amylase polymorphism in Drosophila. VIII Effect of carbohydrate dietary components on a-amylase activity and Amy-electromorph frequency in Drosophila busckii. Genetica, 92(2): 101-106.
- Milanović, M. and M.Andjelković (1993): Biochemical and genetics diversity of alpha-amylase in Drosophila. Archives of Biological Sciences, 45(3-4): 63-82.
- Milanović, M. and M. Andjelković (1992): Adaptive significance of amylase polymorphism in Drosophila. VI. Properties of two amylase variants and the effect of food components on amylase activity in Drosophila subobscura. Comparative Biochemistry and Physiology, 101B(4): 611-616.
- Stamenković-Radak., M., L.Partridge and M.Andjelković (1992): A genetic correlation between the sexes for mating speed in Drosophila melanogaster. Animal Behavior, 43(3): 389-396.
- Andjelković, M., M.Stamenković-Radak, M.Sekulić and M.Milanović (1991): Adaptive significance of amylase polymorphism in Drosophila. III. Geographic patterns in Drosophila subobscura tissue-specific expression of amylase in adult midgut. Genetics Selection Evolution, 23(3): 197-204.
- Milanović, M., M.Andjelković and G.Stamenković-Bojić (1989): Adaptive significance of amylase polymorphism in Drosophila. IV. A comparative study of biochemical properties of a-amylase in Drosophila melanogaster, D.hydei, D.subobscura and D.busckii. Comparative Biochemistry and Physiology, 93B(3): 629-634.
- Andjelković, M., M.Milanović and M.Stamenković-Radak (1987): Adaptive significance of amylase polymorphism in Drosophila. I. The geographical pattern of allozyme polymorphism at the amylase locus in Drosophila subobscura Genetica, 74(3): 161-171.
- Stamenković-Radak, M., M.Andjelković, M.Milanović i M.Sekulić (1986): The sexlinked recessive lethal test for mutagenesis in Drosophila melanogaster - testing of Urotovet®. Acta Veterinaria, 36(4): 219-222.
- Andjelković, M., M.Stamenković-Radak and M.Sekulić (1985): The daily activity rhythm of Drosophila subobscura Collin (Dipt., Drosophilidae) at Ravnište (Jastrebac) locality, Yugoslavia. Acta entomologica Yugoslavica, 21(1-2): 109-118.